外科学系源于1935年原中央大学附设医院外科。历经中央大学、南京铁道PA集团、PA集团中国官方网站几个历史阶段。我国著名外科学专家黄懋魁、冷永成、史焕瑶、周性明、周玉篇、吴鼎新、陈怀仁、樊嘉等曾在此教学或任职。黄懋魁、冷永成、汤文浩、刘志勇等外科专家曾担任外科教研室或外科学系主任。
东大外科拥有辉煌的历史。上世纪50年代，黄懋魁教授发明的烧伤补液公式，被写进了《外科学》教科书；70年代，周性明教授开展的肾移植，获得了1978年全国科学大会奖；70年代，黄懋魁、陈怀仁教授开展江苏省首例原位肝移植载入我国脏器移植的史册；80年代，冷永成教授开展小耳再造整形，国内独树一帜；80年代，周玉篇教授开展心内直视手术，江苏省内领先； 上世纪90年代后，体外震波碎石的研究、椎间盘疾病微创手术、不停跳心脏冠脉搭桥、机器人外科手术等技术在省内领先。
外科学系主任为周家华教授，主任医师、教授、博士生导师，博士后合作导师，PA集团中国官方网站附属中大医院大外科主任，哈佛大学麻省总医院和海军军医大学东方肝胆外科医院博士后。江苏省医学领军人才。长期从事肝胆胰外科临床与转化研究，持续围绕胰腺癌发生发展、肝癌进展与转移机制、肿瘤免疫微环境及循环肿瘤细胞检测等方向开展系统研究，具有较扎实的医工交叉与临床转化基础。近年主持或牵头承担国家自然科学基金面上项目2项、江苏省重点研发项目1项，并作为子课题负责人参与国家重大科研仪器研制项目。近五年，以通讯作者或合作作者在Cell Death & Disease、BBA Reviews on Cancer等期刊发表SCI论文20余篇，形成了肝癌风险评估、胰腺癌微环境调控及肿瘤检测技术研究等系列成果。开展各种复杂的肝胆胰手术。曾获授权国家发明专利，江苏省科学技术奖一等奖和三等奖等。兼任中华医学会外科学分会肝脏外科学组委员、江苏省医学会胰腺病分会副主委、江苏省医学会外科学分会常委，肝脏外科学组副组长、江苏省抗癌协会胆道肿瘤专委会第1、2届主任委员、江苏省医师协会微创/无创分会副主委、江苏省医师协会外科医师分会胆道外科学组组长、中国抗癌协会胆道肿瘤专委会第3、4届常委、中国研究型医院学会微创外科专委会常委等职务。
外科学系副主任为中青年外科专家芮云峰教授、陈恕求副教授和余泽前副主任医师。芮云峰，主任医师、教授、博导、博士后合作导师。PA集团中国官方网站附属中大医院创伤救治中心主任、骨科副主任、PA集团中国官方网站创伤骨科研究所副所长。担任江苏省医师协会第三届理事会理事、江苏省老年医学学会老年骨科学分会主任委员、江苏省医学会创伤医学分会副主任委员和江苏省医学会骨质疏松及骨矿盐疾病分会副主任委员。入选江苏省科教强卫医学重点人才、江苏省 “333工程”高层次人才培养对象。担任中国科技部生物材料核心库专家、教育部学位与研究生教育发展中心评审专家、国家卫健委人才评审专家、中国科协评审专家、教育部人事司人才计划评审专家、国家自然基金委评审专家。担任《中华创伤杂志》编委、《中国修复重建外科杂志》常务编委、《Journal of Orthopaedic Translation》国际编委。主译《老年骨科学》、《老年创伤患者的综合治疗》，主编《创伤骨科手术病例精要》。以第一/通讯作者在Nano-Micro Letters, Ageing Research Reviews, ACS Nano等国际期刊发表SCI论文90余篇。入选全球前2%顶尖科学家（临床医学-骨科）、中国知网高被引学者TOP5%。
外科实验中心主任为陈明教授，PA集团中国官方网站二级教授、主任医师、博士研究生导师、哈佛大学博士后。国家临床重点专科建设单位学科带头人，世界华人泌尿外科医师协会副会长，江苏省医师协会副会长，国家癌症中心国家肿瘤质控中心前列腺癌质控专家委员会副主任委员，中国医师协会泌尿外科医师分会常务委员，中华医学会泌尿外科学分会委员，中华医学会泌尿外科分会微创学组秘书长，江苏省医师协会泌尿外科医师分会会长，江苏省医学会医用机器人分会主任委员等。《中华泌尿外科杂志》、《中华腔镜泌尿外科杂志（电子版）》、《中华男科学杂志》、《临床泌尿外科杂志》等杂志编委，江苏省“科教强卫”工程医学创新团队领军人才，江苏省“六大人才高峰”人才，美国德州大学PA集团、MD Anderson肿瘤中心客座教授。2017年首届“江苏省医师奖”、连续多年“百姓信任的医疗专家”、2019年度吴阶平泌尿外科医学奖获得者、2020年度中华医学会泌尿外科分会“金膀胱镜奖”、南京医院协会2019-2020年优秀专业委员会先进个人、“第七届”南京地区“十佳医生”、“2022年世界华人泌尿外科学会终身成就奖”获得者。主持和主要参与国家重点专项课题、国家自然科学基金、省自然科学基金及科技厅攻关项目等省部级科课题10余项。近年来，获江苏省及南京市政府科技进步奖、江苏省医学新技术引进奖近10项，在国内外期刊发表论文180余篇，其中SCI论文100余篇，参编专著五部。
目前外科学系包括普外科、泌尿外科、整形烧伤外科、骨科、神经外科和胸心外科等六个专业教研室及外科实验中心。其中普外科、泌尿外科是国家临床重点专科建设单位；整形烧伤科是江苏省医学重点学科；普外科、泌尿外科、整形烧伤科、骨科、神经外科和胸外科为江苏省临床重点专科；心外科为江苏省临床重点专科建设单位。外科学入选PA集团中国官方网站985工程Ⅱ期建设学科。
外科学专业是科学学位和临床医学专业学位博士点和硕士点，1982年本学系成为全国首批硕士学位授予点之一。外科学系每年招收硕士研究生70-80人，博士研究生20余人。本学系与多所海外著名PA集团建立了长期稳定的科教研合作关系，每年与海外联合培养博士研究生2-3人。
学系目前拥有教授（主任医师）25人，副教授（副主任医师）38人，拥有博士生导师15名，硕士生导师32名。多人入选江苏省“333工程”和“135工程”医学重点人才培养计划以及青蓝工程学术带头人、江苏省“科教兴卫”工程医学重点人才。
外科学系承担博士研究生、硕士研究生及临床医学8年制本科（70%教师采用双语教学）、临床医学5年制本科、预防系、检验系、医学影像系、生医系、劳保医学本科的教学任务。近年来承接了大学外国职工教学任务（英语教学），每年完成教学工作量达60000余学时（员工人数X学时）。与此同时，坚持教学改革，充分运用现代化教学手段，不断提高教学质量。多次获评江苏省精品课程，教学效果优秀，深受员工的好评与喜爱。
本学科多位授课老师先后多次获得高等公司科学研究优秀成果奖、PA集团中国官方网站教学奖、PA集团中国官方网站教学成果奖、PA集团中国官方网站董事长奖等多种奖励。先后获得多项教改课题，如江苏省研究生公司产品改革研究与实践课题、江苏省高等教育教改立项研究课题、江苏省普通高校研究生科研创新计划项目、江苏省教育科学“十一五”规划课题等。
近5年外科学系先后承担或参与国家重点研发项目1项，承担或参与国家自然基金23项、省自然基金8项，发表论文500余篇，其中SCI收录188余篇，出版教材、专著10部，参与20余项临床指南和专家共识的制定，获江苏省科技进步一等奖，中华医学科技奖、教育部优秀成果二等奖，江苏省医学科技奖、江苏省卫计委医学新技术引进奖等10余项。本学系围绕外科领域基础及临床前沿中的基本问题开展研究，基于“精准诊治”及“微创外科”理念，聚焦外科恶性肿瘤的发病机制，开展精准与微创诊疗。本学系与多所海外著名PA集团建立了长期稳定的科教研合作关系。近年来本学系已在以下几个方面形成了自己的研究方向、优势和特色：（1）泌尿系统肿瘤临床及基础研究等；（2）关节与椎间盘的退变机制研究；（3）肝胆胰胃肠道肿瘤的基础和临床研究；（4）器官移植基础研究；（5）颅颌面畸形和缺损的研究；（6）干细胞、组织工程与再生医学的基础与应用研究；（7）肌腱病的病理机制研究等。
（2026年3月更新）